無癥狀的橋本甲狀腺炎患者，不需要治療。 當病情進展為甲狀腺功能減退時，需要長期服用甲狀腺制劑，以不出現藥源性甲亢為準。一般用藥2-4周后，癥狀明顯改善。 局部有壓迫癥狀或甲狀腺有進行性增大的患者，可以服用甲狀腺制劑進行觀察。服藥后如果壓迫癥狀不緩解，或者臨床高度懷疑出現惡性病變時，需要手術切除甲狀腺，術后服用甲狀腺制劑替代治療。 如果橋本甲狀腺炎的診斷已經明確，不論患者伴有或不伴有甲亢，應該盡量避免手術或放射碘治療，否則容易發生甲狀腺功能減退。