對于肝內膽管的結石，最好是通過手術方式治療，因為此類結石通常是以泥沙狀的性質存在于肝內膽管。膽管內結石可以聚集成團，堵塞后引起相應的癥狀，導致患者反復發生炎癥，甚至導致肝臟萎縮。長此以往，可以導致局部的肝臟癌變，所以肝內的膽管結石治療最好是以手術為主。手術需要打開膽總管，在膽總管內置放膽道鏡，而在膽道鏡的直視下，可以對結石進行沖洗、引流，再進行取石，從而使阻塞的膽管變得通暢。在此基礎上，如果發現肝臟有部分萎縮，應將萎縮的肝臟切除，因為萎縮的肝臟已經在反復的膽管炎刺激下，發生一定程度的變性改變。如果不能將萎縮的肝臟及時切除，在今后的幾年之內，肝臟有可能會癌變為膽管癌。綜上所述，對于肝內膽管結石的合理治療方式是手術。