骨髓炎如果能夠得到早期診斷，選擇合適手術和抗生素進行治療，可以取得良好效果。 慢性骨髓炎治療需要多層面手段，除抗生素抑制、外科手術清創和重建外，還應考慮到患者伴隨疾病，并進行恰當處理，如優化糖尿病患者血糖、戒煙和肝腎功能不全治療。 慢性骨髓炎如不手術難以治愈，抗生素很少能徹底治療各種原因引起的感染，根治一般需要徹底外科手術清創和無效腔處理，聯合有效抗生素治療。局部手術清創聯合抗生素治療，并輔助營養支持治療，可減輕患者痛苦和限制竇道分泌。 治療方法選擇必須根據患者具體情況進行個體化評估，目前慢性骨髓炎治療以大段骨切除以及伊里扎洛夫骨搬移技術為主，已經屬于一次革命，徹底清創后加上骨搬移，往往可以得到徹底根治。