口瘡應與鵝口瘡、口糜、狐惑病鑒別，這些都是中醫上的說法。鵝口瘡在西醫中稱為白色念珠菌病，多見于嬰幼兒或體虛的成年人。臨床表現為口腔黏膜及舌上滿布白屑，狀似鵝口，白色的斑點呈疏松狀，容易擦去，1-2小時后又可復生，擦拭過重容易出血。另外口糜應與口瘡進行鑒別，口糜是現在西醫上講的球菌性口炎。起初口腔黏膜上會出現灼熱的紅斑，繼而出現紅斑處糜爛、灼熱、疼痛，上面覆蓋黃白色的腹膜，界限不清，如雞蛋的內膜不容易擦去。口瘡還應該與狐惑病即我們現在所說的白塞氏病進行鑒別，白塞氏病主要表現為口腔、眼、外陰潰爛為主證，并見精神恍惚不安，常見有發熱、頭暈、疲乏無力、聲音嘶啞、脘腹悶脹、惡心、納呆、關節酸痛等癥狀，皮膚上會出現膿包或紅斑、結節。