由于下頜智齒的位置非常特殊，是最后萌出的牙齒，在萌出時由于下頜骨沒有足夠的空間，很多智齒的位置是非常不正的，有頰向阻生、低位阻生，還有遠中阻生、水平阻生等等，再加上下頜骨的骨質又非常硬，所以在拔除的時候產生的阻力就非常大。通常情況下需要切開牙齦，翻瓣，并且要鑿骨將牙冠分開，創傷比較大，拔除后還需要縫合牙齦。所以術后局部傷口會有明顯的疼痛、腫脹等不適感，有的嚴重的病人還需要術后靜脈輸入抗生素。而上頜智齒因為沒有解剖位置的阻擋，它的牙槽骨非常疏松，拔除時也很容易，一般拔完牙以后也不需要縫合，術后也沒有明顯的不適感。