引起小孩甲狀腺功能低下的原因，主要見于以下幾個方面：1、先天發育異常：先天因素導致甲狀腺組織發育不良或者甲狀腺缺如，都可以導致甲狀腺功能低下；2、先天遺傳性疾病：往往是染色體隱性遺傳病，導致合成甲狀腺素的酶缺乏，從而導致甲狀腺激素不能正常合成；3、飲食不當：在合成甲狀腺激素的時候碘元素必不可少，如果孩子的飲食當中缺乏碘元素，會導致孩子出現甲狀腺功能低下；4、慢性淋巴細胞性甲狀腺炎：容易導致孩子出現甲狀腺功能低下，常與孩子體內的免疫功能紊亂有一定的關系。