三九灸的時間會放到數九之后，一九、二九、三九三個九中，每一個9天艾灸3-4次，即隔天一次或者隔2天一次。三九灸實際上是時間療法，和三伏灸有著類似的含義，三伏灸主要是冬病夏治，在夏天進行補益治療，到了冬天可以預防和減輕呼吸系統疾患，降低哮喘、咳嗽等疾病發生幾率。三九灸主要是振奮一身陽氣，冬天天氣比較寒冷，需要有足夠的陽氣來御寒，在三九天進行艾灸可以溫補全身陽氣，抵御即將到來的嚴寒。三九灸在時間上除了隔天或者隔2天一次外，每一次艾灸的時間保持在30分鐘以內為宜，不要時間過長，同時不要全身出大汗，微微出汗即可，艾灸以后要注意防寒保暖，不要馬上出門。