地衣芽孢桿菌活菌膠囊主要起到調節胃腸道菌群的作用。口服之后能在胃腸道發揮治療作用，能夠釋放出具有抗菌作用的物質，并且能拮抗某些有害致病菌的生長，對于葡萄球菌、酵母樣菌，都具有拮抗作用。另外，還能促進部分有益菌的生長，比如雙歧桿菌、乳酸桿菌，以及部分鏈球菌等。地衣芽孢桿菌活菌膠囊能夠提供無氧環境，促進腸道的厭氧有益菌的生長及恢復。在臨床上主要用于緩解急性、慢性腹瀉，由于胃腸道菌群失調所導致的其他胃腸道不適。由于此藥物是一種活菌制劑，因此在存放時應該避免放置于高溫處，并且在服用時，也避免使用過熱的水。不能與抗生素聯合使用，如果確實需要同時使用這兩種藥品，一定要間隔三小時以上。