殺菌、屏蔽有害物質。地衣芽孢桿菌是腸道的一種益生菌，結腸里面有很多對身體有益的細菌，叫腸道益生菌。這些益生菌的存在，可以防止有害菌的生長，同時也是腸黏膜屏障的組成部分，吃進去的東西有時候會有細菌、毒素，第一道關卡就是胃酸可以有殺菌的作用，然后進入小腸、結腸就是靠腸黏膜屏障，才能把這些有害物質屏蔽在血液之外。如果腸黏膜屏障受損，有毒有害物質會進入血液，引起菌血癥、敗血癥甚至膿毒血癥，因此作為腸黏膜屏障的組成成分，腸道益生菌對身體是非常有益的，也是有用的。一旦出現腸道菌群失調，就需要及時補充。出現菌群失調時，會引起腹痛、腹瀉、腹鳴、腹部不適、腹脹這些癥狀，可以用地衣芽孢桿菌來進行腸道益生菌的補充，這個細菌還可以有利于雙歧桿菌這一類更好的有益菌生長，所以有時也會配合跟雙歧桿菌一起應用。