目前甲亢的治療首選藥物治療，二線治療為手術和碘-131治療。不主張進行手術和碘-131治療，因為手術可能造成喉返神經損傷，以及其他問題，另外碘-131有放射性，故兒童甲亢最佳治療方案是藥物治療。 部分兒童因中午在學校進食，一天三次服藥不方便，而甲巰咪唑藥物作為主要的甲亢用藥，屬于長效藥物，一天一次或者一天兩次服用即可，相對比較方便。另外，抗甲狀腺藥物主要副作用是白細胞降低、肝功能損害，甚至出現血管炎癥性改變，但甲巰咪唑藥物副作用相對較少，故可作為藥物治療的首選。