兒童甲亢的病因尚未完全明確，考慮與基因背景、遺傳因素、環境因素以及免疫紊亂均有關。目前認為可能有遺傳易感基因的人群中，當甲狀腺細胞在受到某些環境因素的影響，比如感染、應激、攝入碘過多、精神壓力等刺激之下，會促使機體產生甲狀腺相關抗體，最后導致甲狀腺功能亢進發生。 碘是合成甲狀腺素的原料，如果攝入過多碘，容易造成甲亢。正常人的代謝和抗體免疫功能沒有問題，不會發生甲亢，由于兒童時期、免疫紊亂或者遺傳當因素而導致的甲亢，攝入碘過多可能僅是一個導致甲亢發生的誘因。如果攝入碘過少，即大脖子病，屬于甲狀腺功能減低的情況。另外，甲亢也會使患者出現甲狀腺腫大，進而出現脖子變大的癥狀。