腳的小拇趾疼痛的原因如下：1、腳趾勞損：由于走路過多或負重，引起水腫；2、局部的關節滑膜病變：考慮是否有痛風等全身性疾病，引起局部的關節滑膜病變發作；3、小趾病變：排除小趾是否有囊腫、肌腱以及骨關節的病變，小拇趾在腳的行走和負重，起著比較重要的作用。由于頻繁行走，腳活動過多，或長時間負重引起的局部疼痛，類似于滑膜水腫或滑膜炎癥，出現疼痛癥狀；4、痛風：特殊疾病引起的小腳趾關節疼痛，由痛風疾病引起，可能食用嘌呤含量較高的食物而誘發，比如動物內臟、海鮮、啤酒等，出現局部的紅腫熱痛；5、關節退行性病變：年齡增大引起關節退變、滑膜炎癥；6、類風濕疾病：除痛風外，類風濕疾病也會引起局部腳趾疼痛；7、關節病變或組織生長異常：比如生長囊腫，肌腱中囊腫出現腱鞘囊腫或腱鞘炎卡壓。骨關節的病變，有骨疣或甲下的腫瘤的長，也可能導致小腳拇趾疼痛的發生。