引起小拇趾疼痛的常見原因如下：1、勞累：勞累后可引起關節、滑膜的水腫，甚至出現腱鞘炎。大拇趾為行走過程中受力點較集中的部位，如果頻繁、長時間、長距離的活動，可導致大拇趾周圍結構水腫，出現局部按壓疼痛；2、拇外翻：在人群中發病率較高，大拇趾向小指方向偏斜，和第一腳掌成夾角，夾角突起較明顯，穿鞋子受力時因磨損會出現拇囊炎，引起大拇趾疼痛；3、代謝性疾病：如痛風患者攝入高嘌呤食物且含量較高，此時因代謝較少引起嘌呤在體內過多積聚，出現高尿酸血癥，最常于大拇趾局部出現代謝沉積，引起痛風性拇趾疼痛、紅腫和局部疼痛，嚴重時出現痛風石沉積；4、其他：如糖尿病足末梢循環不良，甲溝炎引起局部感染，拇趾長囊腫或腫瘤也可出現疼痛，需逐個分析并對癥處理。