眼睛胬肉手術屬于眼科二類手術。雖然僅切除眼睛表面肉狀物，但手術還是會有一些風險，包括出血、感染等。另外，手術可能造成斜視，因為胬肉切除過程中，可能損傷眼睛肌肉，導致后期出現斜視、視物重影等現象。 雖然胬肉手術存在相應風險，但就診于專科醫院進行手術，風險相對較低。如果胬肉未積極解決，過渡至嚴重時期，侵入瞳孔中央可能加重病情，甚至導致失明。