嬰兒腸套疊發病率相對比較高，引起腸套疊的病因尚不十分清楚，推測可能跟以下的機制有關系。1、食物變化：嬰兒到了6個月月齡以后，從乳類食物逐漸開始添加一些其他的輔食，逐漸過渡到幼兒的飲食，隨著食物的添加，有可能誘發沒有發育成熟的胃腸功能出現紊亂，導致嬰兒容易出現腸套疊，嬰幼兒時期也是腸套疊發病的高發期；2、感染：比如腸道內的腺病毒或者是輪狀病毒感染，都可以誘發嬰兒出現腸套疊；3、嬰兒腸道解剖關系：還跟嬰幼兒腸道的解剖因素有關系，嬰幼兒往往腸系膜相對比較長，所以腸管相對比較游離，固定得不好，在出現胃腸功能紊亂的時候，容易導致蠕動紊亂，會誘發腸套疊；4、腸痙攣和自主神經功能調整紊亂：還有嬰兒腸套疊的高發，可能跟嬰兒的腸痙攣和自主神經功能調整紊亂等都有關系，嬰兒在有炎癥或者是著涼，或者是感染刺激，或者食物刺激的時候，容易出現腸道蠕動紊亂，容易出現逆蠕動，會導致嬰兒出現腸套疊；5、先天性腸道畸形：還有有些腸套疊的發生，跟嬰兒存在著先天性的腸道畸形有關系，比如部分嬰兒患有美克爾憩室或者是患有腸重復畸形，都可以誘發嬰兒出現腸套疊。