如果鼻竇炎和過敏性鼻炎同時存在，可以采用藥物治療同時治療兩個疾病。過敏性鼻炎患者可能需要使用鼻用激素，還有鼻用或者口服的抗組胺類、抗白三烯類藥物。鼻竇炎患者在使用鼻用激素的同時，還需要給予黏液促排劑，有時還需給予抗生素等藥物。此時可以同時給患者使用兩種藥物，從而使患者在抗過敏的同時，也能有效治療鼻竇炎。如果患者存在部分解剖上的畸形，或者是鼻竇炎伴有鼻息肉，還需要進行鼻內鏡手術，來矯正畸形、切除鼻腔息肉、開放鼻竇，才能使鼻腔黏膜恢復正常的引流和通氣，使鼻竇炎和過敏性鼻炎得到良好的控制。鼻竇炎和過敏性鼻炎經常同時存在，尤其是在花粉季節，尤其是過敏性鼻炎的患者，鼻腔黏膜會出現高度水腫，會引起鼻竇經常性繼發性感染，從而導致鼻竇炎。