出入第一肝門的結構包括肝臟動脈、門靜脈、膽管以及在第一肝門包裹管道結構的淋巴、脂肪等組織。第一肝門是重要的管道結構進出肝臟的位置，而肝臟存在雙重血液供應，進入肝臟的血管包括肝臟的動脈及門靜脈。其中肝動脈給肝臟提供氧氣，而門靜脈則收集來自消化系統，特別是胃腸道、胰腺、脾臟的血液。上述血液中含有豐富的營養物質以及身體的代謝廢物，可通過門靜脈進入肝臟，既給肝臟提供營養，又需要肝臟對代謝廢物進行轉化、解毒等。膽道含有肝內的各級膽管匯合而成的肝總管及膽總管，而膽汁由肝臟合成，再經由膽道系統流入十二指腸，從而幫助脂肪類食物的消化及吸收。此外，包裹管道結構的還包括淋巴組織以及脂肪組織等。