無痛胃鏡的風險最主要來自于無痛麻醉，醫生靜脈用藥使患者處于全麻狀態，在這個過程中可能會出現麻醉意外，比如血氧下降、心律失常、誤吸甚至窒息等意外，特別是高齡或者有心肺基礎病的患者。 因此，患者在進入診室以后，可以主動告訴麻醉醫生自己的基礎病，比如有無冠心病、高血壓、糖尿病、哮喘等疾病，或者最近有無感冒史，這些都可以幫助麻醉醫生更全面的評估患者整體情況，在麻醉全過程都有麻醉醫生全程監護。因此，無痛胃鏡并無痛苦，不影響智商，比較安全。