現在越來越多的淋球菌會產生耐藥性，即使使用頭孢曲松和阿奇霉素聯合治療，還有極少數人沒有實現治愈或者又復發，有可能已經產生耐藥性，可能會需要更多的抗生素、長療程或者更大劑量的治療。在這種情況下，建議做微生物培養，也就是取膿性分泌物，做微生物培養，如果培養到淋球菌，可以去做藥敏試驗，篩選出敏感的藥物，包括喹諾酮類藥物都已經有了耐藥性。所以現在更強調規范治療，才是降低耐藥性的最佳途徑，如果產生耐藥，治療的費用可能就會增加。