胚胎和囊胚是受精卵發育的不同階段，在體外受精和胚胎移植的技術中，胚胎發育是從第零天的合子，第二天到第四天的卵裂球胚胎，第五天和第六天的囊胚，是胚胎細胞數逐漸增多的不同階段的稱呼。因此，胚胎和囊胚都是胚胎，胚胎移植主要是第三天的卵裂球胚胎和第五天和第六天的囊胚。兩者主要的不同是胚胎發育階段第三天，是胚胎發育的八細胞階段，八細胞階段是胚胎具有全能性。理論上如果僅有一個正常的卵裂球，發育的潛力足夠，都可能發育成一個正常的個體，胚胎也開始進入一個快速的分裂期。所以這個階段胚胎的碎片對胚胎的影響相對較小，在發育到第五天形成了好的囊胚，可能胚胎的細胞數達到100多個。囊胚此時可以分成內細胞團和滋養層細胞，細胞開始出現分化。分化的細胞可以行使不同的功能，但是細胞還具有多能性，此時部分細胞中的碎片反而被胚胎吸收，囊胚看上去又更加完美了。