肝門部膽管癌手術后的預后相對不太理想偏差，是因為分化程度低，而且能達到R0切除的幾率相對偏低，是因為位置所做決定，因為肝門部膽管癌上下不到3cm的距離，所以要按照腫瘤根治的標準，腫瘤應該是上方切到1.5cm，下方要切到1.5-2cm，如果是Ⅲ型高位膽管癌能做半肝切除，而且有些患者即便是Ⅲ型高位膽管癌，做了半肝切除也達不到根治，因為有血管侵犯也有的有各種各樣的原因。比如膽管侵犯、血管侵犯，還有肝臟局部受侵犯，這些達不到根治，所以肝門部膽管癌基本整體預后沒有中位和低位的效果好，也沒有肝癌效果好。因為肝門部膽管癌位置比較特殊，不像低位膽管癌可以隨意切，中位膽管癌也是上下都可以拓展，只有高位膽管癌無法切，尤其像Ⅳ型高位膽管癌只能做肝移植。但也不是每個患者、每個家庭都能接受肝移植，主要考慮肝源的問題，還有費用問題，因為肝移植價格昂貴。