咽鼓管功能不良的病因很多，最常見的是炎癥。咽鼓管是鼻子跟耳朵唯一溝通的管道，非常窄，炎癥的原因很多時候是因為鼻炎，特別是感冒之后，鼻炎一直從咽鼓管蔓延到中耳，所以整個咽鼓管也發炎，這種情況最為常見。另外還要排除特殊情況，有些占位病變，比如鼻咽部長東西、咽鼓管通路上長東西使其堵塞，這種情況也是存在的。還有些較少見的原因，比如咽鼓管本身是個很細的管道，上面有些液體會缺失，叫做酶類缺失，整個咽鼓管并不是開放得非常好，這種情況也有。此外，因為咽鼓管的開放有兩塊肌肉作用，張嘴或者咬牙時肌肉會收縮，咽鼓管就容易張開，肌肉功能變差也會導致咽鼓管功能不良。