心臟神經官能癥在臨床上是一種排除性疾病，器質性心臟病通常有客觀存在的胸痛、胸憋不適等癥狀。心臟神經官能癥在臨床中主要是圍繞患者胸痛的原因做鑒別診斷，排除心臟、高血壓、冠心病等疾病引起的胸痛，還要排除胸部疾病，如胸膜炎、結核或氣胸等器質性疾病引起的胸痛或肋神經炎，以及皮膚科還會見到帶狀皰疹的病人。排除以上由疾病引起來的胸痛，還有客觀的心臟不舒服或胸痛癥狀，便可診斷為心臟神經官能癥。