部分患者的心臟神經官能癥可以自愈。心臟神經官能癥是功能性疾病，與情緒有密切關系，它通常有一定的誘因，部分患者甚至合并更年期綜合征或者焦慮、抑郁等情緒，如出現不順心或者煩心的事情，會誘發心臟神經官能的出現。如果此類事件過去以后，患者的心情會逐漸平復，情緒不再緊張或激動，癥狀也會逐漸地緩解。另外，部分患者有更年期綜合征，會伴有心臟神經官能癥，隨著逐漸地適應體內較低的雌激素水平，心臟的癥狀會緩解或者消失。但是有些焦慮或者抑郁的患者，通過治療后，甚至睡眠改善以后，焦慮、抑郁的情緒可以得到緩解，心臟的不適癥狀也會緩解，部分患者可能甚至不需要進行心臟方面的藥物治療，則可以自愈。