全飛秒激光手術又叫小切口角膜基質透鏡取出術，原理是用全飛秒激光在角膜的基質層間打出相應度數的透鏡，通過非常小的切口把透鏡取出，達到矯正近視的目的。 它對角膜厚度的要求比半飛秒激光要更加嚴格，因為透鏡取出的前提是要在前面做120μm左右的角膜冒，下方由于設計手術方案的原因，切除的角膜基質要更多，而且因為切口小，操作角膜基質的深度會更深，所以要求角膜厚度要高于半飛秒激光的條件。 如果角膜的整體條件符合要求，通過全飛秒激光手術大概能矯正聯合散光在1000度以下，但是保守估計，從最佳的手術效果800度中間含有散光以下的度數，做全飛秒激光效果較好。度數太低也不主張做全飛秒激光，因為做激光透鏡時，如果度數太低做的透鏡會很薄，對取出透鏡的手術操作有一定難度。所以度數太低的、在100度左右的近視，也不主張做全飛秒激光。手術范圍在200-900度聯合散光是較佳的手術范圍。