根管壁側穿是牙髓治療失敗的重要原因，常常是由于不正確的開髓、擴根方法所導致，樁核制作時的盲目操作也會造成側穿。如果穿孔能夠早發現、早治療對預后影響較大。一般新鮮的穿孔直徑＜1mm，相對預后良好，陳舊性直徑＞3mm的穿孔，則預后不確定，需要定期觀察隨診，因此臨床上正確判斷穿孔的發生十分必要。 穿孔出現的主要表現為拔凈牙髓以后根管內出血明顯，吸潮紙尖中部有血跡，尖端干凈。X線診斷絲從根管壁穿出，根管長度測量儀在根管側未到根管工作長度時顯示超出根尖孔，顯微鏡下可以看到明顯的穿孔部位和牙周軟組織的粉紅顏色，或者是陳舊的壞死樣軟組織。 根尖部穿孔往往是由于器械尖端沒有順應根管的彎曲形態，或者是工作長度確定不準確，器械過度預備所致的根尖部根管壁穿孔，在穿孔前往往先出現根尖偏移，包括臺階的形成、根尖拉開等根中部側穿。根尖區穿孔在做了完善的根管治療以后，配合根尖手術及根尖切除，加上根尖倒充填。 根中部的穿孔可以在顯微鏡下從根管內修補，或者是根充后外科手術修補，MTA是修補的良好材料。根管頸部穿孔多發生在尋找和擴大根管口及GG鉆應用不當時，特點是預備過程中突然出血，肉眼或者是鏡下可以直視穿孔存在。X線診斷絲照相和根管長度測量儀可以幫助確診。頸部穿孔可以通過髓腔內修補或者是手術翻瓣修補。