各種手術都會帶來風險，準備充分的病人手術風險也不能完全排除，但是可以盡量降低其發生的可能性。對于急性腸梗阻進行急診手術的患者，由于其術前準備相對欠佳，另外病人的一般情況差一些，發生各種手術并發癥的風險相對大一些。這些風險可分成手術方式所帶來的并發癥、心肺常規并發癥、出血感染相關并發癥等。不同手術方式會有不同風險，例如做腸吻合手術，可能會有吻合口出血、吻合口狹窄、吻合口瘺等等。如果是做腸外置手術，可能會出現外置口出血、缺血壞死、回縮、造口旁疝等。如果病人術前心肺基礎情況不好，可能會導致心力衰竭、肺部感染以及急性肝功能、腎功能出現障礙。另外就是常規的手術風險，因為做腸梗阻手術時，腹腔內往往處于一種污染環境，可能會出現腹腔感染以及繼發全身感染等等。