根管治療的原理是通過物理和化學的清洗，將髓腔以及根管內的感染物清理出去。在既往未用顯微鏡時，其清理全靠診療醫生的肉眼和感覺操作，很難將根管內的感染組織清理得非常徹底，而顯微鏡可將視野放大至10-30倍，可非常直觀的將根管內的感染物質清理得非常的徹底。此外，顯微根管操作時，在視野增大的情況下，醫生無法快速的清理感染物，其操作非常的緩慢、輕柔，患者更加能適應，且無論是根管清理，還是后期的根管充填，患者感覺的痛苦非常小，治療的效果更加好。所以，顯微根管治療是根管治療的趨勢，一般根管治療無法替代。