放射性骨髓炎預后常常不是很理想，原因是整個放射區域的肌肉、皮膚和骨頭，實際上都受到了損傷，而發生炎癥只是在整個受到放射損傷區域內的一小部分，即使得到了有效正確治療，局部區域可能恢復的很好并不等于以后不會再發生，不會波及到其他區域。所以臨床常常見到放射性骨髓炎在局部切除后，可能過兩天上頜骨又出現了炎癥，盡管這種情況不多見但是有可能發生。放射性的骨髓炎包括骨、軟組織、肌肉，全方位的損傷，所以病人手術以后功能恢復比較慢，很難達到完全的正常，所以預后只是解決壞死骨頭，骨頭連續性的問題，并不等于把骨骼質量恢復到正常，因此預后仍然要注意不要再次發生。