心源性腦栓塞的病人要定期監測血常規、血凝，長期使用抗凝藥，只要病情穩定，形成血栓的病因沒有去除，抗凝藥就不能停。如果在用藥期間發現血小板減少，血凝明顯延長，即有出血傾向，抗凝藥只能停用，但是停藥也就難以達到預防腦栓塞的效果。現在有新型的心臟介入手術、左心耳封堵術，左心耳是心臟結構中附壁血栓的集中地，把左心耳用介入材料封堵后，左心耳附壁的血栓就不能進入血液循環，從而防止腦栓塞再發生，手術后，這類病人就不需要服用抗凝藥物了，也就降低了抗凝的出血風險。目前臨床上使用的有新型口服抗凝藥物，如達比加群酯、利伐沙班等，這一類新型抗凝藥不需要監測血常規和血凝，病人使用更加方便，但是無論哪一種抗凝藥物，都是長期口服。