目前治療反流性咽喉炎最有效的藥物是質子泵抑制劑，常用的藥物有奧美拉唑、艾司奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑等。這類藥物主要作用在胃部專門產生胃酸的細胞，通過阻斷重要環節達到抑制胃酸效果。對比以往使用的抑酸劑如雷尼替丁、法莫替丁而言，具有抑酸作用強、起效快、持續時間長等優點。 除了上述特效藥以外，糾正不良的生活習慣也非常重要，如避免睡前飲食，提倡高枕臥位，三餐不能過飽，戒煙酒、濃茶、咖啡，少吃油膩性的食物、甜食、酸性的水果如橘子、楊梅等，生活方式的改善將更有助于提高治療效果。