治療男性不育癥的藥物分為以下幾類：1、激素類藥物：如克羅米芬、他莫昔芬，小劑量雄激素，還有肌肉注射的絨促性素、尿促性素等，需要根據精液質量來選擇治療的藥物，如少精子癥可以使用克羅米芬或者他莫昔芬、來曲唑，幫助提高睪丸的生精功能。無精子癥，尤其是非梗阻性無精子癥，部分醫生建議使用絨促性素或者尿促性素，改善睪丸的生精功能，使精液中出現精子；2、抗氧化藥物：存在營養成分，如肉堿、維生素E、鋅、硒等，幫助改善精子的活力。抗氧化主要以提高活力為主，也可能對改善精子的DNA碎片率有幫助；3、中藥或者中成藥：可用來治療男性不育，改善男性的精液質量。 不育癥男性通過藥物治療后，需定期進行精液常規檢查了解療效。男性不育用藥治療通常時間較長，如果藥物治療效果不佳，需要尋求其它的治療方式，如輔助生殖。