兒童左腎囊腫主要與發育因素和遺傳因素有關，少數可能為獲得性。不同類型兒童腎臟囊性疾病的發病年齡不相同，可發生于嬰兒期、兒童期或成人期，還可貫穿其中。與發育有關的腎臟囊性疾病由先天發育不良引起，可造成腎臟囊發育不良、髓質海綿腎。先天發育異常的腎臟囊性疾病一般基因無異常。遺傳性腎臟囊性疾病主要是基因突變和染色體異常所致，大部分通過父母遺傳引起，分為常染色體顯性和常染色體隱性。但部分多囊腎患者既非父母遺傳，同時也不屬于先天發育不良性多囊腎病，為胚胎期基因突變引起。 獲得性腎臟囊性疾病兒童相對少見，如單純性腎臟囊腫、低鉀腎臟囊性疾病，孤立性多發囊腫、腎淋巴管瘤等疾病與終末期腎病透析、移植有關。因此兒童左腎囊腫的原因應綜合分析，判斷有無家族史、遺傳史、囊腫數量，預后存在差異。