檢測幽門螺桿菌無創方法首選碳13或碳14呼氣試驗，理論上兩種檢測都是檢驗幽門螺桿菌的金標準。碳13是穩定同位素，無任何放射性，而碳14檢測有微弱放射性。因此，對于老年人、體弱多病者、兒童、孕婦或哺乳期病人，往往選擇碳13檢測，因為沒有放射性。碳14雖然有一定放射性，但碳14檢測垃圾也沒有作為放射性垃圾處理，故碳14對于普通人群也可選擇，但要根據患者身體狀況決定。 若患者擔心有放射線，就選擇碳13。若無此方面顧慮，就選碳14。兩種檢測方法準確性無明顯差別，往往碳13價格會稍微高些。所以，無論選擇碳13還是碳14呼氣試驗進行幽門螺桿菌檢測，若檢測值高于標準值，提示有幽門螺桿菌感染，這時要咨詢醫生是否需根除幽門螺桿菌。