甲狀腺癌的發病病因尚不明確，但沒有與生物性傳染相關的證據。甲狀腺癌不是傳染性疾病，因此不會通過唾液傳播，并且不會通過空氣、飛沫或接觸等傳染病傳播途徑傳染。甲狀腺癌發生可能與相關因素有關，主要是內因以及外部因素長期作用形成，例如兒童期接受過較高劑量輻射、肥胖，碘攝入量可能與甲狀腺癌發病存在一定關系。另外，肥胖是甲狀腺癌發病因素。 兒童期受過電離輻射是甲狀腺癌發病相對較確鑿的因素，主要證據來源于兒童期受過核事故輻射以及兒童期接受過頭頸部，胸部放射治療，發病率明顯提高。但不是兒童期接受過輻射一定會發生甲狀腺癌。當前肥胖人群較多，而肥胖與多種疾病發病有關，經過調查發現，肥胖人群甲狀腺癌發病率升高較明顯，可能比不肥胖的人群高9%以上。 研究表明碘攝入量過多或過少都會增加甲狀腺癌發病概率，但我國學者對沿海地區攝碘量較高人群調查發現，碘攝入量與甲狀腺癌發生無明顯相關性，所以碘與甲狀腺癌發生關系不確鑿。除外部因素外，遺傳因素在甲狀腺癌中發揮一定作用，如果患者家族當中存在患甲狀腺癌病史，近親家屬中發生甲狀腺癌的概率可以增高8-10倍。