賁門潰瘍是消化科常見情況，大部分由于胃食管反流引起。指由于賁門功能出現障礙，例如賁門口松弛使胃和十二指腸內容物反流到食管，可以引起胃和十二指腸交界處尤其是賁門的黏膜損傷。此時建議患者可以服用抑酸藥物，例如雷貝拉唑、奧美拉唑可以有效抑制胃酸對于賁門黏膜的損傷。還可以加用黏膜保護劑，常用鋁鎂制劑，可以有效中和胃酸、保護賁門黏膜。 另外，少部分患者賁門潰瘍是由于賁門惡性疾病例如賁門癌引起。如果內鏡病理檢查找到腫瘤細胞，建議積極進行手術治療。此外少數患者可能和克羅恩病等炎癥性腸病有關，一般都和自身免疫相關，服用抑酸藥同時根據患者病情，甚至可以酌情加用免疫抑制劑或免疫調節劑進行治療。