如果可以確診為病毒性腦炎或者細菌性腦炎，越早選用合適的抗病毒藥物和合適的抗生素進行治療越好。不同種類的腦炎，治療的時間、療程會有所不同，常見分為以下幾種：1、病毒性腦炎：早期可以使用抗病毒藥物進行治療，通常需逐量使用抗病毒藥物。經過2-3周治療，才可有效控制病毒性感染引起的腦炎；2、細菌性腦炎：需要進行2-3周的抗生素治療；3、結核性腦炎：這類情況可能需要長時間治療。需要早期3個月的治療，后續再通過調整藥物進行治療，6個月左右為規范的抗結核治療過程，需要足療程、足量的藥物治療，通過積極治療，可以改善腦炎的癥狀；4、真菌感染引起的腦炎：需要進行規范的3個月左右的抗真菌治療，從而可改善癥狀。