臨床沒有氣管結核的概念，一般定義為氣管內膜結核，氣管內膜結核患者行氣管鏡沒有嚴格規定次數，主要根據行氣管鏡目的。如果以診斷為目的，鏡下進行刷檢、活檢、肺泡灌洗甚至穿刺活檢，來幫助明確診斷即可。少數患者一次檢查不能確診時可行二次或多次氣管鏡檢查。支氣管內膜結核氣管鏡的陽性率較高，多數患者一次就可以。 若以治療為目的，根據目的不同氣管鏡檢查次數也不同。支氣管鏡內膜結核鏡下藥物治療，目前認為局部給藥可使藥物直接作用到病灶區域，增加病變局部藥物濃度，更有效起到殺菌、抑菌作用。國內外研究報道：氣管內局部用藥可以加快痰菌轉陰，減少氣管狹窄發生。對于瘢痕狹窄型患者，氣管鏡可行介入治療，根據狹窄部位、程度分別可以給予球囊擴張、冷凍治療或植入支架等。