氣管鏡檢查很少出現遠期并發癥，但氣管鏡屬于創傷性檢查，在操作過程中可能存在一定并發癥和意外情況，具體如下： 1、操作過程中需要使用麻醉藥物，故有可能出現麻醉反應和藥物過敏，嚴重者可能會出現休克，以及心跳、呼吸驟停等； 2、檢查過程中需要活檢，有可能會引起組織出血，嚴重大出血甚至可能會出現窒息，包括心腦血管意外，以及心跳、呼吸驟停、腦出血等； 3、在操作過程中可能使原發感染部位感染病灶播散，出現新感染病灶，引起周圍組織損傷，甚至氣胸等。 上述意外都有可能發生，但發生可能性相對較小，術中會常規進行心率、血壓、呼吸頻率、血氧監測、常規吸氧，支氣管鏡室也配備了氣管插管和搶救藥品、設備。