小兒吸入麻醉的副作用其實是全身麻醉中的一種，吸入麻醉藥有可能會造成患兒惡心、嘔吐的情況，可能會比靜脈麻醉更高。有些小孩可能對吸入藥有反應，可能會引起煩躁、過敏。有些患者可能會出現惡性高熱，吸入麻醉藥造成惡性高熱的可能性，比靜脈麻醉造成惡性高熱的可能性高。但如果基因好，基本上沒有太大問題。 吸入麻醉的缺點在于惡心、嘔吐的可能性比靜脈麻醉更高，結束麻醉之后患兒煩躁的可能性更高。但在整個過程中，醫生會按照小孩的情況進行調控，可以用吸入，也可以用靜脈，也可以用靜吸復合，保證小兒麻醉手術順利進行，保證小兒手術過程中的舒適，讓副作用更少，舒適度更高。