人乳頭瘤病毒39型陽性，若是單純感染則并不嚴重；但若是引起上皮病變，則比較嚴重。建議根據不同的病變，進行不同的治療。具體如下：1、單純感染不嚴重：若人乳頭瘤病毒39型陽性，但沒有引起宮頸上皮病變，此時并不嚴重。建議定期給予復查，因為絕大部分人乳頭瘤病毒39型，經過1年左右會自行轉為陰性，所以沒有必要緊張；2、引起上皮病變則較嚴重：若人乳頭瘤病毒39型陽性，并且導致宮頸上皮病變，則比較嚴重。若出現低級別的癌前病變，可考慮做激光治療，主要是使病變的組織壞死、脫落，達到臨床治愈的目的；若宮頸上皮在高危HPV39型感染下，已經發生高級別癌前病變，建議做宮頸的錐形切除手術治療。此外，在術后需要定期復查，若已經發生癌變，建議做相應手術治療。此外，一旦人乳頭瘤病毒39型轉為陰性，而又沒有其他HPV病毒感染，建議接種HPV疫苗，以便減少HPV感染的可能性。