預防風濕性心臟瓣膜病的根本措施是避免產生風濕熱，風濕性心臟瓣膜病產生的原因大多是患者年輕時患風濕熱，其是由于鏈球菌感染而產生的發熱，以及一系列呼吸系統的癥狀，稱為風濕熱。鏈球菌感染后，鏈球菌中某些成分與心臟成分類似，會導致免疫系統攻擊心臟成分，長期后會導致心臟瓣膜出現損傷。所以預防風濕性心臟病最根本的措施，即盡量不感染鏈球菌，不要得風濕熱。有時無法完全避免病原菌的感染，需要在早期通過規范的抗生素治療，將風濕熱治愈。部分高危患者治愈后，可能需要長期使用長效青霉素間斷注射，預防風濕熱的復發，以及鏈球菌的再次感染，預防風濕性心臟瓣膜病。