所有的手術和操作都具有不同大小的風險。我國是在1986年開展肺灌洗術，主要應用于塵肺病的治療，技術比較成熟。目前我國大概30余家醫療單位已開展肺灌洗術治療，尚未見有死亡病例或者醫療事故的報道，臨床效果肯定且安全。肺灌洗常見的并發癥有低氧血癥、肺出血、氣胸、心律失常、發熱、肺水腫等，但并發癥發生率較低，且通過處理，大都恢復良好。相對來說，全麻下大容量肺灌洗術的并發癥發生率稍高于經纖支鏡灌洗術，因此對于病人的選擇方面要求更高。如果醫生在灌洗前對病人做好評估，病人在灌洗前做好心理準備，加上醫務人員熟練的灌洗技術，以及及時處理好相關的并發癥，風險一般可以避免。