口舌生瘡的患者具體使用的藥物要特別注意，如果口舌生瘡由感染所致，可能考慮使用消炎藥物，如青霉素類的阿莫西林、阿奇霉素類藥物、頭孢類藥物，盡量選其一。對于舌頭以及牙齦深部組織的炎癥，甚至可以考慮加用硝唑類藥物，將厭氧菌得以控制，如甲硝唑、奧硝唑或者替硝唑，選其一即可。硝唑類的藥物與上述藥物之間最好間隔10分鐘再進行口服，同時要注意在使用藥物之前，一定要注意藥物過敏史，如果有以上藥物過敏史的患者，不要使用此類藥物。在使用藥物的前一周和后一周，以及使用藥物期間，絕對禁止飲酒，否則會引起非常嚴重的不良后果。對于口舌生瘡的患者，還可以考慮使用一些外用藥物，如漱口液以及外用涂抹的促進潰瘍愈合的藥物等，同時保持口腔清潔衛生，飯后漱口，預防感染。