腎結石做體外沖擊波碎石后出現疼痛，有可能以下原因：1、結石嵌頓：腎結石碎石后形成小的結石，小的結石如果直徑＜4mm，通過大量排尿可以順利排出體外；如果直徑＞6mm，有可能卡在輸尿管和腎盂的部位，不能排出體外；而4-6mm直徑的結石，正好和輸尿管以及尿道的直徑差不多，很容易在下行過程中卡在輸尿管上或輸尿管狹窄的部位，造成疼痛的情況，此疼痛很劇烈，是輸尿管疼痛向下腹部放射，如果出現嚴重的情況，有可能出血或造成輸尿管梗阻部位上端積水，需要做泌尿系統彩超進行鑒別診斷；2、感染：結石內部常有很多細菌，當碎石后細菌釋放出來，造成泌尿系統的感染，特別是腎盂腎炎的感染，從而出現腎區的疼痛、壓疼以及叩擊痛，此時可以出現尿頻、尿急、尿痛的癥狀，類似急性腎盂腎炎。此時的治療，除對腎結石治療外，還需要應用抗病原微生物的藥物進行抗細菌治療，或抗相應的病原微生物治療，才能使疼痛得到緩解乃至消失。