體外腎結石碎石整體疼痛程度大多數患者可以耐受，但需根據患者個體的耐受程度而定。因為體外碎石時是經過腰部垂擊一樣的感覺，有些患者疼痛會比較厲害，需要應用杜冷丁，甚至局部止疼藥，但大多數患者可以耐受。此外，碎石時一些小渣子會隨著碎石過程的延續，沿著輸尿管向下移動，此時并不可控，形成的局部疼痛有些人也比較明顯，屬于一個排斥過程。此類疼痛很多人都會有，若碎得足夠微細，程度會較輕，但若是比較大的小碎石頭，排出去之后局部癥狀會很明顯。此外，還有碎石頻率，包括碎石強度，通常碎石頻率越快，疼痛感越強。雖然碎石強度越高，碎石效率會越高，但局部引起疼痛也會加重。因此，體外腎結石碎石疼不疼一看患者的耐受程度，二看局部碎石的頻率，包括碎石強度，這些不同也會引起碎石的程度、感受、疼痛度不同。