煙霧病手術相對其它神經外科手術而言，是一種并發癥相對更多的手術。手術后早期可能出現腦過度灌注綜合征，或手術后可能出現缺血發作，且都可能影響病人出院時間。一般如果手術順利，病人往往在1-2周后出院，回家后緩慢恢復一段時間，繼續服用藥物，沒有特殊情況即可。 如果手術不順利或手術后出現其它并發癥，并不是一定造成不良預后，有可能是手術后正常出現的并發癥，如腦過度灌注綜合征，腦過度灌注綜合征就是因把顱外血流引到顱內后，導致短期血流灌注過多，大腦需時間調節，接受外來血流，再進行腦血流重新分配，往往在手術后兩周內大腦會完成自身適應，因此住院時間會延長。如果出現腦梗塞、癲癇發作，也可能導致住院時間延長，但往往在1-2周病人即可出院。