頭很痛但是做了腦CT又顯示正常，有如下幾種情況：1、功能性因素或者原發性頭痛，如焦慮、抑郁、情緒不好引起的繼發性頭痛，原發性頭痛像偏頭痛、叢集性頭痛、緊張性頭痛、三叉自主性頭痛，這些疾病都沒有病灶，做CT、磁共振都是正常的。因為上述疾病不是惡性腫瘤，血管也沒有堵塞，也沒有炎性損害，自然做影像學檢查沒有問題，這時經過醫生診斷，如果是焦慮、抑郁引起，或者原發性頭痛，不必特別擔心，也有相關的藥物進行治療，不是所有的頭痛，都一定能看到病灶。2、腦部存在疾病，但是CT檢查不出來，這些器質性疾病如腦炎、腦膜腦炎，進行CT檢查就是看不到病灶，即使做了磁共振，有些病灶也不太明顯，做增強CT才有可能會看到腦膜有點強化、增厚，腰穿腦脊液是有異常的，壓力是升高的。3、其他器質性疾病，比如可逆性腦血管收縮綜合征和高血壓性腦病繼發的頭痛，這些在影像學上也沒有明確發現，CT由于分辨率有限，也沒有特別多的序列，對這些疾病的診斷都是不利的，如果做了磁共振還有血管成像，診斷率就會更高。所以具體問題要具體分析，需要到神經科就診做進一步的篩查。