莫西沙星和頭孢是兩種不同的抗生素，從抗菌譜、藥理作用方面都有不同。首先頭孢類分為一代到四代，一共有四大類頭孢菌素，這四代頭孢菌素對于抗菌譜、不良反應方面都有一些差別，比如一代頭孢更多對陽性菌感染效果比較好，三代頭孢對陰性菌感染效果比較好，四代頭孢是廣譜抗菌藥物，對陽性菌、陰性菌感染都有效果。莫西沙星是喹諾酮類抗生素，和頭孢類不一樣，莫西沙星是廣譜抗生素，對陽性菌、陰性菌都有比較好的抗菌活性，對厭氧菌或者支原體、衣原體效果也比較好。 除此之外，莫西沙星和頭孢相比不良反應方面也有一些差別，比如對于腎功能的影響，頭孢類對腎功能影響比較大，莫西沙星對腎功能影響可比較小，即使患者既往有腎功能不全，使用莫西沙星時也不需要調整劑量。總之，頭孢和莫西沙星分屬不同抗菌素類別，在抗菌活性、不良反應方面都有比較大的區別。