支氣管擴張為結構改變，在擴張局部纖毛細胞會被破壞。痰液很難被咳出，會造成局部的反復感染，病人會不斷用抗生素。抗生素剛開始用時較敏感，但越用越耐藥，故治療效果逐漸變差。 另外長期用抗生素，可能會出現真菌感染。本病易遷延不愈，抵抗力下降，有時會引起結核感染，所以支氣管擴張因惡性循環反復感染，最后造成肺功能減退，造成肺心病、肺動脈高壓、肺氣腫，嚴重者可導致呼吸衰竭。 支氣管擴張反復的感染可以引起咳血，甚至大咯血，所以支氣管擴張一定要在早期積極控制反復感染。